Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms