Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan6O70401 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan6O70401 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan6O70401 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan6O70401 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan6O70401 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms