Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syngr2O55101 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms