Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2f6O54917 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2f6O54917 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2f6O54917 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2f6O54917 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2f6O54917 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2f6O54917 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f6O54917 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f6O54917 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms