Protein–RNA interactions for Protein: O35648

Cetn3, Centrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn3O35648 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cetn3O35648 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms