Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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