Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm17577J3QNF7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm17577J3QNF7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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