Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms