Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20517G3UVU6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20517G3UVU6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms