Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm28038F7BCN9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm28038F7BCN9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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