Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms