Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms