Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms