Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp54bE9PXC0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms