Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms