Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol6B7ZC55 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol6B7ZC55 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms