Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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