Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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