Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms