Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samt1A2BED8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms