Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms