Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setbp1Q9Z180 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setbp1Q9Z180 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms