Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scnn1bQ9WU38 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms