Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfwd2Q9R1A8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms