Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms