Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms