Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms