Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms