Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms