Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms