Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET52

Cts6, Cathepsin-6, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts6Q9ET52 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cts6Q9ET52 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cts6Q9ET52 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms