Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms