Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms