Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rsph9Q9D9V4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rsph9Q9D9V4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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