Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms