Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms