Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ubxn11Q9D572 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms