Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms