Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms