Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsl3Q9CZW4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsl3Q9CZW4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms