Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis18aQ9CZJ6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms