Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms