Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx2Q9CWK8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx2Q9CWK8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms