Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsmce3Q9CPR8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsmce3Q9CPR8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsmce3Q9CPR8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsmce3Q9CPR8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsmce3Q9CPR8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsmce3Q9CPR8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms