Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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