Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Apobec3Q99J72 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apobec3Q99J72 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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