Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csmd1Q923L3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms