Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb6Q922F4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms