Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms