Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms